La méthode LAMP, une solution rapide et sur-mesure développée par l’ADRIA
Dans un contexte où la qualité microbiologique est un enjeu clé de la sécurité alimentaire, la capacité à détecter rapidement les germes indésirables, même rares, devient un levier stratégique pour les industriels. À l’occasion de la Journée mondiale de la sécurité sanitaire des aliments 2025, l’ADRIA met en lumière une innovation qui change la donne : la technologie LAMP, une méthode de détection rapide, spécifique et transposable, développée au service des entreprises agroalimentaires.
Une technologie innovante pour une détection ciblée et rapide
La méthode LAMP (Loop-mediated Isothermal Amplification) est une technique d’amplification isotherme de l’ADN. Contrairement à la PCR classique, elle ne nécessite pas de thermocycleur et peut être mise en œuvre simplement, avec un résultat en moins d’une heure. C’est une solution particulièrement adaptée aux environnements agroalimentaires où le temps de réponse et la facilité d’utilisation sont des critères clés.
En combinant rapidité, robustesse et spécificité, LAMP permet de détecter des micro-organismes d’intérêt, même ceux qui échappent aux méthodes traditionnelles comme les cultures ou les PCR standards. Elle est particulièrement efficace dans les matrices complexes et à faibles niveaux de contamination.
Kazachstania barnettii : une levure indésirable identifiée grâce à la méthode LAMP
Un cas concret illustre parfaitement l’intérêt de cette approche. Une PME agroalimentaire européenne, spécialisée dans les tartinables bio sans conservateurs, était confrontée à des altérations irrégulières (gonflements, bulles, colonies visibles) sur un de ses produits. Malgré plusieurs mesures correctives, aucune cause précise n’avait pu être identifiée.
L’ADRIA a mené un diagnostic complet :
- analyses microbiologiques classiques,
- séquençage génétique des colonies isolées,
- étude bibliographique approfondie.
Résultat : Kazachstania barnettii a été identifié. Il s’agit d’une levure altérante capable de résister aux acides organiques, de se développer à 4 °C, et de produire du gaz – un profil qui explique les déformations observées en fin de vie du produit.
Une méthode LAMP sur-mesure, conçue pour un diagnostic industriel
Pour répondre à cette problématique, les équipes ADRIA ont conçu une méthode LAMP spécifique à K. barnettii, selon une démarche rigoureuse :
- définition des séquences cibles,
- optimisation du protocole d’enrichissement,
- validation sur matrices réelles (produits finis, matières premières, surfaces),
- détermination de la sensibilité analytique (POD 50).
Testée sur plus de 140 échantillons, la méthode a permis de :
- localiser la contamination sur une machine spécifique (9 échantillons positifs sur 10),
- détecter la présence du germe dans certains bulbes végétaux utilisés dans la recette,
- orienter les actions correctives : nettoyage vapeur, lavage des bulbes au vinaigre, etc.
Ces mesures ont permis de réduire significativement la prévalence des altérations, tout en maîtrisant les coûts et délais d’analyse.
Une approche transposable à d’autres problématiques
L’intérêt de la méthode LAMP ne se limite pas à ce cas. Elle est transposable à d’autres germes altérants ou pathogènes, en particulier :
- des levures peu connues ou non identifiables par culture,
- des bactéries spécifiques d’un process ou d’un environnement,
- des matrices sensibles ou complexes (produits acides, gras, riches en sucres, etc.).
En fournissant des résultats rapides et exploitables, cette technologie permet aux industriels de :
- renforcer leur plan de contrôle microbiologique,
- réagir rapidement en cas de contamination,
- valider des actions de nettoyage-désinfection,
- ou encore mieux documenter leur plan HACCP.
Une expertise ADRIA au service de l’agroalimentaire
La réussite de cette méthode repose sur la complémentarité des compétences mobilisées :
- expertise microbiologique et génétique,
- connaissance fine des environnements industriels,
- capacité à concevoir des protocoles adaptables, fiables et robustes.
Ce type de prestation sur-mesure illustre la vocation d’ADRIA : apporter des solutions concrètes, validées scientifiquement, aux problématiques industrielles, dans une logique de réactivité, de pertinence et de transfert d’innovation.
Une innovation soutenue par le Carnot AgriFood Transition
Le développement de cette méthode s’inscrit dans les travaux menés au sein du Carnot AgriFood Transition, dont ADRIA est membre. Ce partenariat permet de connecter la recherche appliquée aux enjeux terrain, et de proposer des outils directement utilisables par les professionnels de la filière.
La publication dédiée par le Carnot est disponible ici.
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